Après la mort de saint Jean de Dieu à Grenade (Espagne) le 8 mars 1550, son corps est enseveli dans l’église de Sainte-Marie-de-la-Victoire, qui appartenait à l’Ordre de saint François de Paul. Après de nombreuses difficultés, ses fils hospitaliers obtiennent que la dépouille de leur saint fondateur soit transférée le 28 novembre 1664 dans l’église de leur hôpital, et la déposent sur le maître autel au cours d’une cérémonie solennelle. Le Supérieur général, Frère Alonso Pardo Ortega de Jésus fait construire une église grandiose, dédiée au saint fondateur et fait déposer ses reliques dans le ‘Camarin’ au-dessus du maître-autel. Benoît XV, élève cette église au rang de basilique, le 20 décembre 1916.